Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2AP24928 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2AP24928 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms