Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRHP20396 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRHP20396 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRHP20396 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRHP20396 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRHP20396 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRHP20396 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRHP20396 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRHP20396 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRHP20396 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms