Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERCC3P19447 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.3 ms