Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CD44P16070 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CD44P16070 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CD44P16070 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CD44P16070 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CD44P16070 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms