Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC5A1P13866 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms