Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ODC1P11926 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODC1P11926 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODC1P11926 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODC1P11926 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODC1P11926 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ODC1P11926 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ODC1P11926 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ODC1P11926 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms