Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DMDP11532 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DMDP11532 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DMDP11532 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DMDP11532 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DMDP11532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DMDP11532 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DMDP11532 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DMDP11532 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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