Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PF4V1P10720 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PF4V1P10720 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms