Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms