Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RGPD2P0DJD1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RGPD2P0DJD1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms