Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB7P09629 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB7P09629 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms