Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MMP10P09238 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP10P09238 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP10P09238 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MMP10P09238 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP10P09238 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP10P09238 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MMP10P09238 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms