Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACAA1P09110 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACAA1P09110 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms