Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPBP07199 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPBP07199 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPBP07199 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPBP07199 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPBP07199 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPBP07199 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms