Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-DOAP06340 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms