Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGAP02671 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGAP02671 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGAP02671 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGAP02671 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FGAP02671 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGAP02671 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms