Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DQB1P01920 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HLA-DQB1P01920 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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