Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CBX7O95931 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX7O95931 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CBX7O95931 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CBX7O95931 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms