Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDX58O95786 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DDX58O95786 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX58O95786 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX58O95786 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX58O95786 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX58O95786 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DDX58O95786 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms