Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCNKO75909 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCNKO75909 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms