Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VAMP4O75379 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms