Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CUBNO60494 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms