Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHX16O60231 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
DHX16O60231 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHX16O60231 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHX16O60231 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms