Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCO2O43819 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCO2O43819 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms