Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SYNGR3O43761 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms