Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYNGR2O43760 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYNGR2O43760 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms