Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STX6O43752 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STX6O43752 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STX6O43752 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STX6O43752 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms