Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPATO15228 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPATO15228 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPATO15228 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPATO15228 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPATO15228 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPATO15228 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPATO15228 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPATO15228 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GNPATO15228 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPATO15228 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPATO15228 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms