Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARPC1BO15143 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms