Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SEMA3EO15041 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms