Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIMBP2O15034 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIMBP2O15034 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms