Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BQV1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BQV1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BQV1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BQV1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BQV1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BQV1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BQV1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BQV1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BQV1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BQV1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms