Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H3BNH8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H3BNH8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3BNH8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3BNH8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3BNH8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3BNH8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H3BNH8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H3BNH8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H3BNH8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms