Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM1B2RUZ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms