Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NPIPB5A8MRT5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms