Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C5orf49A4QMS7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C5orf49A4QMS7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms