Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPDC1A2A3K4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPDC1A2A3K4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms