Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ9

TRAV30, T-cell receptor alpha variable 30 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30A0A087WSZ9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAV30A0A087WSZ9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAV30A0A087WSZ9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms