Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms