Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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