Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP3R2-201ENST00000374806 3387 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PGM3-212ENST00000513973 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESR1-206ENST00000427531 5436 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDHB1-201ENST00000306549 8210 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms