Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PICALMQ13492 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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