Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD160-204ENST00000584442 219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006504.5-211ENST00000588636 576 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AURKC-206ENST00000598785 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010615.2-204ENST00000600469 830 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL590999.1-202ENST00000607215 3053 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018554.3-201ENST00000614215 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMCR2_1.1-201ENST00000621493 157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 IPO4-221ENST00000625289 297 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00282-201ENST00000626362 654 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM238A-202ENST00000637359 442 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078776.2-201ENST00000641021 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LIMCH1-203ENST00000396595 5740 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC8D-202ENST00000394593 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF5A-202ENST00000455537 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTY-201ENST00000329134 4325 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HCAR3-201ENST00000528880 2137 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD302-204ENST00000553424 3866 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 BBS10-201ENST00000393262 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASTN2-204ENST00000358637 3411 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIS3L2-204ENST00000409307 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSHZ1-201ENST00000322038 4992 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCAM1-221ENST00000615112 5967 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1C-202ENST00000335762 6968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RELN-201ENST00000343529 11565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RACGAP1-201ENST00000312377 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3TC2-215ENST00000515425 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 HECTD4-202ENST00000377560 15759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF774-202ENST00000379090 5613 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TENM2-207ENST00000520394 8034 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-312ENST00000641391 2488 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-378ENST00000642009 2463 ntAPPRIS P2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH26-202ENST00000348616 3182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP1A2-201ENST00000361216 5421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC26A9-201ENST00000340781 4510 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPFIA2-205ENST00000541570 2976 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-202ENST00000374870 4644 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALOXE3-202ENST00000380149 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTCFL-216ENST00000608263 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL7-201ENST00000260505 7976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGD3-201ENST00000337352 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF135-203ENST00000401053 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms