Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCIRG1Q13488 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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