Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPROQ16827 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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