Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
ATP1A4Q13733 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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