Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VPREB1P12018 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VPREB1P12018 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms