Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
LHX8Q68G74 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 A1CF-201ENST00000282641 9350 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LRIG3-202ENST00000379141 3667 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
LHX8Q68G74 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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