Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
U3KQE9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
U3KQE9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
U3KQE9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
U3KQE9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms