Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K4Q9Y6R4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K4Q9Y6R4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms